Múzeumi gyűjteményi rend

I. Orvostörténeti Szakgyűjtemény

1. Orvosi eszközök, műszerek, készülékek
2. Szemüvegek, fogsorok, műlábak
3a. Orvosságtartók
3b. Homeopata kézipatikák
4. Régészeti anyag

II. Gyógyszerésztörténeti Szakgyűjtemény

1. Fajansz, porcelán állványedényzet
2. Fa-, Fém állványedényzet
3. Üveg állványedényzet
4. Laboratóriumi edényzet
5. Patikaeszközök, készülékek
6. Mozsarak
7. Patikabútorok, berendezési tárgyak, tartozékok, házi patikák

III. Embertani Szakgyűjtemény

1. Koponyák, csontvázak, múmiák
2. Anatómiai készítmények

IV. Orvosi és Gyógyszerészeti Emlékek Szakgyűjteménye

1. Orvosok személyes emléktárgyai
2. Gyógyszerészek személyes emléktárgyai
3. Egészségügyi intézmények emléktárgyai

V. Néprajzi Szakgyűjtemény

1. Magyar népi gyógyászati tárgyak
2. Külföldi népi gyógyászati tárgyak

VI. Természettudományi és Gyógyszerésztani Szakgyűjtemény

1. Ásványtár
2. Növények, drogok
3. Állatpreparátumok
4. Gyógyszerek

VII. Balneológiai Szakgyűjtemény

1. Balneológiai emléktárgyak
2. Eszközök, készülékek, tartozékok

VIII. Képzoművészeti Szakgyűjtemény

1. Festmények
2. Rajzok
3. Szobrok, domborművek
4. Sokszorosított művészeti alkotások

IX. Iparművészeti és Keleti Szakgyűjtemény

1. Bútorok, berendezési tárgyak
2. Textil, szőnyeg
3. Vegyes európai iparművészeti tárgyak
4. Keleti és egyéb egzotikus iparművészeti tárgyak

X. Numizmatikai Szakgyűjtemény

1. Antik pénzek
2. Történeti érmék
3. Személyes érmék
4. Városi érmék
5. Miscellanea
6. Kegyérmék
7. Jelvények
8. Rendjelek
9. Sorsjegyek

XI. Történeti Dokumentációs Szakgyűjtemény

1. Írott emlékek, kéziratok
2. Nyomtatványok
3. Képi emlékek (régi fotók, albumok, rajzok)
4. Hangemlék

XII. Adattár

1. Adattár – kéziratok
2. Filmtár
2a. Fotó anyag
2b. Diatár
2c. Mozgófilmek